Нет более удивительного места, чем Акихабара! Этот город сумел стать настоящим домом для людей с самыми разными талантами. Именно там живут главные герои, которые посвятили свою жизнь науке. Ринтаро Окабэ сумел собрать вокруг себя лучшую команду. Итару Хасида является лучшим хакером в городе, а Маюри Сиина остается душой их дружной компании. Но, наиболее талантлив среди них Курису. Именно он оставался одним из главных проектировщиков будущего проекта.
Трудно поверить в создание настоящей машины времени. Тем более, она была собрана из всякого хлама, месяцами собираемого ребятами на распродажах и свалках. Сама машина получила название «Врата Штейна». Теперь ведь можно ее испробовать? Главным героям нужно быть готовым к последствиям. Однажды после такого перехода они обнаруживают мертвого Курису. Попробовав пройти сквозь «Врата» заново, вновь что-то изменилось. Их друг оказался жив, но объективных причин этому нет. Ринтаро не знает, что они меняют каждый раз при прохождении в другое время. Чем же это закончится?